Microbioma é o termo usado para se referir a uma coleção de microrganismos de um particular ecosistema. Show
Microbioma Humano é o conjunto de microrganismos que habitam as várias partes do corpo como pele, cabelo, cavidade oral, vias aéreas, trato gastrointestinal e trato urogenital de um indivíduo saudável. Podemos dizer que é a primeira linha de defesa contra diferentes patógenos microbianos, auxilia na digestão e contribui para a maturação do sistema imunológico. Também podemos ter como sinônimos:– Microbiota normal – Microbiota indígena – Microbiota autóctone – Microbiota residente O termo Disbiose refere-se ao desequilíbrio na microbiota e está associado as doenças. O corpo humano tem mais microrganismos que células humanas sendo de fundamental importância essa associação entre microrganismos e homem para a saúde humana. Projeto Microbioma Humano “Individuo Saudável”NIH Human Microbiome Project A fase inicial foi completada em 2012 e deixou evidente que o microbioma humano é complexo, composto por muitos organismos não reconhecidos previamente e sofre alterações dinâmicas na doença. Os 5 objetivos do projeto eram: – Desenvolvimento de um conjunto de referência de 3.000 sequências de genoma microbiano isolado – Gerar uma estimativa da complexidade da comunidade microbiana em cada local do corpo, com isso responder se existia um microbioma “central” em cada local – Determinar a relação entre doença e mudanças no microbioma humano – Desenvolvimento de novas ferramentas e tecnologias computacional, estabelecimento de um centro de análise e coordenação de dados e repositórios de recursos – Avaliar as implicações éticas, legais e sociais no estudo e aplicação da análise de metagenômica da microbiota humana. – O Programa: custou $173 milhões e avaliou 300 indivíduos saudáveis em 18 locais de coleta no corpo com duração de 7 anos (2007 – 2014). – Esse projeto foi realizado por 80 Universidades – Identificaram 100 trilhões de microrganismos – Possui 10 vezes mais células do que os que temos em nossos corpos – Possui 10 vezes mais células procariontes – Corresponde a 1-3% do peso corporal – Possui mais de 10.000 espécies microbianas – Genoma humano possui 22.000 genes – Microbioma contribui cerca de 8 milhões de genes – 360 vezes mais material genético – 80-95% dos microrganismos não são cultiváveis in vitro Tipos de MicrobiotaMicrobiota Residente São microrganismos do tipo relativamente fixos e são encontrados com regularidade em determinadas áreas e em certa idade, e quando ocorre uma perturbação consegue se recompor prontamente; Microbiota Transitória (ALÓCTONE ou EXÓGENA) Os Microrganismos podem ser potencialmente patogênicos ou não patogênicos e habitar a pele e/ou membranas mucosas por horas, dias ou semanas, mas que não se restabelecerão autonomamente. Geralmente são de pouca importância, enquanto a microbiota residente normal permanece intacta. Porém, se a microbiota residente for perturbada, os microrganismos transitórios poderão colonizar e proliferar-se, ocasionando doença.
Habitantes do intestinoFirmicutes: Quebram grandes moléculas presente nos alimentos e aumentam nossa capacidade de absorver calorias e armazém as gordura. Bacteroidetes: A proporção destas bactérias no intestino dos indivíduos magros é maior que no dos obesos. Aparentemente tem função no controle do peso. Proteobacterias: É um grupo heterogêneo sendo que alguns causam doenças como as E. coli e Salmonella. Actinobactérias: Algumas aumentam as defesas e regulam o trânsito intestinal. Benefícios da microbiota normal– Síntese e excreção de vitaminas – Evita colonização por patógenos – Pode antagonizar outras bactérias – Produção de anticorpos naturais – Estimula o desenvolvimento de alguns tecidos – Estimula produção de anticorpos naturais Fatores que influenciam o estabelecimento da microbiota– Dieta – Genética – Metabolismo (fatores hormonais) – Condições ambientais (sanitárias, etc.) – Hábitos de higiene – Idade MetagenômicaÉ a sequência do DNA e a análise genômica de uma comunidade microbiana. Identifica-se o genoma de comunidades de micro-organismos que habitam o mesmo ambiente ou parte de seu genoma. Aplicações da Metagenômica– Descoberta de enzimas de interesse industrial. – Compostos com interesse farmacológico, por exemplo antibióticos ou antifúngicos. – Revela interação entre diferentes espécies de micro-organismos. – Revela micro-organismos envolvidos em saúde/doença. – Entender a dinâmica das comunidades microbianas. – Estudos filogenéticos Sequência para obtenção da metagenômica:– Construção de uma biblioteca metagenômica com este DNA misto. – Sequência de todo o DNA das amostras ou sequencias conservadas. – Não há necessidade de cultivar ou isolar os microrganismos (essa etapa é importante, pois sabemos cultivar cerca de 1% destes microrganismos). E com isso permite a análise de espécies não cultiváveis em laboratórios. – Análise de Bioinformática. Dificuldades em Metagenômica– Purificação do DNA – Contaminação de amostras – Análise das sequências – Geração de muitos dos dados de metagenômica (gigabases) – Erros na montagem devido a similaridade entre espécies semelhantes – Dificuldade de sequenciamento de genomas menos representados na comunidade de microrganismos. Como as bactérias alteram sua composição gênica?Mutação: – Cromossômica – Plasmidial Recombinação: – Conjugação – Transdução – Transformação Transposons: – Elementos genéticos móveis que conferem resistência à drogas Função da MicrobiotaBiofilme protetor: Competição com bactérias patogênicas por sítios de adesão e microambientes (antagonismo microbiano); Ativamente envolvida na regulação imune e na homeostase; Exerce funções-chave no metabolismo do hospedeiro, auxiliando na digestão e absorção de alimentos; Fatores externos e endógenos podem alterar a microbiota drasticamente levando ao desenvolvimento de populações de patógenos oportunistas QUER APRENDER MAIS SOBRE METAGENÔMICA? Acesse o nosso curso sobre metagenômica ou o combo com 5 cursos inclusos. Clique na imagem a seguir! Referências: 1 – Changes in the composition of the human fecal microbiome after bacteriotherapy for recurrent Clostridium difficileassociated diarrhea. J Clin Gastroenterol 2010; 44: 354-360. 2 – F. Baquero and C. Nombela (2012) The microbiome as a human organ. Clin Microbiol Infect 2012; 18. 3 – The human microbiome: at the interface of health and disease. (Nature Reviews Genetics 13, 260-270 (April 2012) | doi:10.1038/nrg3182). 4 – Experimental and analytical tools for studying the human microbiome. (Nature Reviews Genetics 13, 47-58 (January 2012) | doi:10.1038/ nrg3129). 5 – The Gut Microbiota. (DOI: 10.1126/science.336.6086.1245). Qual a diferença da microbiota transitória para a residente?Podem ser distinguidas a microbiota residente, constituída por organismos específicos, encontrados, freqüentemente, em determinadas áreas e a microbiota transitória, que consiste de microrganismos provenientes do ambiente, que habitam a pele e as superfícies mucosas por horas ou poucas semanas.
O que é microbiota residente e microbiota transitória?A microbiota normal é composta por diferentes microrganismos que se estabelecem permanentemente dentro do trato gastrointestinal e não causa doenças aos hospedeiros em situações normais. Já a microbiota transitória permanece no TGI por um período variável de tempo.
O que é uma microbiota transitória?A microbiota transitória consiste de microrganismos não-patogênicos ou potencialmente patogênicos, tais como bactérias, fungos e vírus, que raramente se multiplicam na pele. No entanto, alguns podem provocar infecções relacionadas à assistência à saúde.
Qual a diferença entre a flora transitória e a flora residente?As floras residentes são os microorganismo que habitam a nossa pele e a flora transitória são os microorganismo que se aderem a pele, sendo responsável por tantas infecções hospitalares.
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